OriginPro:ROC曲线【数据绘图】
OriginPro:ROC曲线【数据绘图】
ScientificPlots
专注于数据绘图和分析。Originlab,Excel,……
ROC曲线 的全称是受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic)曲线,是非常重要和常见的统计分析方法。
如果已经计算好
FPR
和
TPR
,可以直接使用最简单的
Line
图绘制。本教程使用的是原始数据,需统计计算后给出对应的参数,并绘制
ROC曲线
。
数据格式
-
示例数据为使用两种方法测量得到的RMSF患者和正常人的钠水平,数据格式为
XYY
形式,其中第1列为人群信息,第2列为Method1测量的结果,第3列为Method1测量的结果。
绘制图形
-
选中后两列数据,使用
Statistics
菜单中的ROC Curve
来绘制图形。 -
在弹出的对话框里设定参数。
-
Positive State Value
:设定哪个State
是正类,此处选择 RMSF 。 -
Threshold Method
:设定求解cutoffs
的方法,可以使用默认选项。 -
Test Direction
:选择检测的数据方向,Positive v.s. High
指大的测量值表示正类,Positive v.s. Low
指的小的测量值表示正类。此例中选择Positive v.s. Low
,即钠水平较小时为正类。 -
ROC Curve
:勾选时会输出 ROC曲线 。 -
Standard Error and Confidence Interval
:勾选后输出 曲线下面积 (AUC
)的SE和可信区间。 -
With Diagonal Reference Line
:勾选后显示参考线,即(0,0)-(1,1)的连线。
-
Optimal Cutpoint
:勾选后显示最佳截断点。
-
Recalculate
:选中重计算方式,默认的是Manual
,即手动更新。 -
Input Data
:在Data
里选定两种方法的测量结果,即第2和3列;在State
里选择第1列数据。 -
Computational Control
:在此处设定相关的计算参数。 -
Output
:输出数据的选项,可以使用默认值。 -
点击
OK
后得到结果,包括统计分析数据和图,其中Area Under the Curve
表示的就是曲线下面积。
格式设定
-
双击分析报告里的 ROC图 ,在单独窗口中打开图形。
-
可以对最后的 ROC图 进行格式设定,包括曲线粗细、颜色、图例等。【在微信公众号 数据绘图 (
ScientificPlots
)后台回复 格式 ,查看详细教程】
完成图形
所用软件:OriginLab OriginPro 2022@Windows 11 pro 。
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